主要有两种类型：1）基于风险的ARM嵌入式工控主板和基于x86的嵌入式工控主板。基于X86的嵌入式工控主板（通常使用INTEL，via，AMD或其他X86芯片制造商，例如：台湾RDC，台湾ICOP等）；基于Risc的ARM嵌入式工控主板（ARM许可，每个都有自己的特殊功能）。嵌入式ARM板通常是板CPU，而不一定是基于x86cpu的主板。
常见的5寸板、PC104板、MINI-ITX、PICO-ITX、NANO-ITX、ETX等都属于嵌入式主板的板型。
嵌入式主板比较常见的一般有两大类：基于X86的嵌入式主板基于RISC的ARM 嵌入式主板（由ARM公司授权生产，每个芯片产家各有自己特殊的功能）。嵌入式的ARM板一般都是板载CPU，而基于x86 CPU的主板则不一定。
简单地说嵌入式工控机的结构可分为5种，如下说明。无源底板 无源底板的插槽由ISA和PCI总线的多个插槽组成，ISA或PCI插槽的数量和位置根据需要有一定选择，该板为四层结构，中间两层分别为地层和电源层，这种结构方式可以减弱板上逻辑信号的相互干扰和降低电源阻抗。
嵌入式系统按形态可分为设备级（工控机）、板级（单板、模块）、芯片级（MCU、SoC）。从定义中不难看出，当前较多使用的单片机设计与工控机设计也是一种典型的嵌入式系统应用。但是这种早期嵌入式系统在性能与价格上均存在一些缺陷。
ATX 主板（ATX Motherboard）：ATX 是 Advanced Technology Extended（高级技术扩展）的缩写。ATX 主板是一种常见的主板类型，具有较大的尺寸和扩展性。ATX 主板通常提供 24 个内存插槽、8 个 PCI 插槽以及许多其他扩展插槽。
如果你的嵌入式x86是裸奔的，而且没有用到这些标准输入输出设备，可以不需要BIOS。但如果嵌入式x86使用了操作系统，就难免需要BIOS的支持了。
嵌入式系统本身就是一种计算机，一般都要有操作系统及应用软件，BIOS是基本系统，开机后要引导，调用基本的应用程序和系统设置。
BIOS：是一组固化到计算机内主板上一个ROM芯片上的程序，它保存着计算机最重要的基本输入输出的程序、开机后自检程序和系统自启动程序，它可从CMOS中读写系统设置的具体信息。特点不同 Boot：可以在x86计算机上建构，但这部x86计算机必须安装有可支持特定平台结构的交互发展GNU工具链。
Linux是在GNU公共许可权限下免费获得的，是一个符合POSIX标准的操作系统。Linux操作系统软件包不仅包括完整的Linux操作系统，而且还包括了文本编辑器、高级语言编译器等应用软件。它还包括带有多个窗口管理器的X-Windows图形用户界面，如同我们使用Windows NT一样，允许我们使用窗口、图标和菜单对系统进行操作。
简单地说，嵌入式系统集系统的应用软件与硬件于一体，类似于 PC 中 BIOS 的工作方式，具有软件代码小、高度自动化、响应速度快等特点，特别适合于要求实时和多任务的体系。嵌入式系统主要由嵌入式处理器、相关支撑硬件、嵌入式操作系统及应用软件系统等组成，它是可独立工作的“器件”。
硬盘启动方式传统的Linux系统运行在台式机或者服务器上，这些计算机一般都使用BIOS引导，并使用磁盘作为存储介质。Linux传统上是LILO （Linux Loader） 引导，后来又出现了GUN的软件 （Grand Unified Bootloader） 。 这两种Bootloader广泛应用在X86的Linux系统上。Flash启动方式。
一般嵌入式所用的 CPU 多为 arm 架构的 CPU 。这个架构是特殊设计的，与 X86 不兼容。所以两个系统的二进制程序不同用。对于 Linux 来说，他们的源代码大部分是通用的（除了那些针对某种 CPU 或者设备进行特殊算法优化的，或者没有避让某些架构对于源代码编写的特殊要求的）。
正由于他们架构的区别，指令集的差异，所以他们的软件运行环境不同，编译环境也不同，有些软件做了兼容性处理，可以直接在两个不同架构下编译。
在不同的目标体系结构下（x86，ARM，PowerPC etc.），由于汇编指令集的不同，同一段代码利用不同的编译器和库文件生成的可执行代码是不同的。不同体系的Linux其开发工具是不同的。
网络通讯不同 嵌入版：嵌入版没有网络通讯功能，不支持串口通讯、Modem串口通讯、以太网TCP/IP通讯，不能实现远程数据传输。通用版：通用版没有网络通讯功能，不支持串口通讯、Modem串口通讯、以太网TCP/IP通讯，不能实现远程数据传输。
Linux操作系统软件包不仅包括完整的Linux操作系统，而且还包括了文本编辑器、高级语言编译器等应用软件。它还包括带有多个窗口管理器的X-Windows图形用户界面，如同我们使用Windows NT一样，允许我们使用窗口、图标和菜单对系统进行操作。
1、功效：这是ARM主板最大的优点之一，一般的VIA的X86主板，功耗都在40W左右或者以上，而ARM主板的功耗极低，EICB系列主板功耗整体也只有1W左右，因此具有着可靠的运行稳定性。发热：ARM主板极低的功耗，因此ARM主板工作温度一般是常温，可以常温下常年累月开机工作时不会出现高温死机等问题。
2、、功耗：这是ARM主板最大的优点之一，一般的VIA的X86主板，功耗都在40W左右或者以上，而ARM主板的功耗极低，如：微嵌的工业平板电脑（使用ARM架构），在关掉背光情况下，其主板功耗整体也只有1W左右。
3、、性能：目前来看，ARM主板的性能已经越来越接近X86主板，甚至在某些方面超过了它。从视频多媒体、数据通信等几个方面，和X86有些类似.（2） 发热：ARM主板不会发热，主板温度一般是常温，因此可以一直常年累月开机在线工作，不会出现任何问题。